Como é típico das doenças genéticas, muitas classes de mutações têm sido identificadas na DTS. No gene HEXA foram encontrados os seguintes tipos de mutações: a substituição de nucleotídeos - na qual ocorre a troca de um único nucleotídeo (mutação puntiforme) numa sequência de DNA, podendo alterar o código de uma trinca de bases e levar à substituição de um aminoácido por outro no produto génico. Outro tipo é a mutação sem sentido (nonsense), a qual gera um dos três codões de “stop”. Existem, ainda, as mutações de correcção (splicing) do RNAm; as que afectam as bases necessárias no sítio doador (limite exão-intrão) ou aceitador (limite intrão-exão) da correcção, interferindo na correcção normal do RNAm naquele sítio, e em alguns casos até erradicando-a. 

As mutações na DTS também podem ser causadas pela inserção ou pela delecção de um ou mais pares de bases. No caso de delecções ou inserções envolvendo apenas alguns pares de bases (pequenas delecções ou inserções), quando o número de bases envolvidas não é múltiplo de três, a mutação de uma sequência codificadora altera a matriz de leitura da tradução a partir do ponto de mutação que resulta numa sequência de aminoácidos diferentes na extremidade carboxil da proteína codificadora – estas são as mutações por mudança na matriz de leitura, as quais também podem produzir codões de “stop”.

Também foram identificadas na DTS grandes delecções, as quais apresentam grandes alterações da estrutura do gene.